通常情况下，脑发育不良可以进行健脑补肾治疗，一般可以可以给儿童使用安神补脑液、补肾地黄丸，都可以良好的帮助大脑发育。其次还可以给儿童使用优甲乐来治疗，因为脑发育不良可能是甲状腺分泌不足导致的。
另外，还可以艾灸儿童的足三里穴、肾腧穴；艾灸足三里穴一般可以起到健脾作用，而艾灸肾腧穴，一般可以起到补肾的作用，当脾肾功能充足后，脑发育不良的情况可以得到明显的改善。
一般情况下，大脑的发展可能会造成儿童的智商下降，严重的还会造成肢体动作和言语能力下降。在所有的智力缺陷患儿中，大约四分之一的智力是正常的，大约1/2的智力是轻度和中度的，1/4的是中度智力的。对于轻微的脑发展不良，可以通过饮食和药品结合进行调理，平时可以多食用一些益气活血、健髓益智的食品，比如核桃仁、牡蛎、深海鱼等。在药物方面可以选择一些药物，比如维生素E、甲钴胺等，可以促进大脑血液循环，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
如果仅仅的只有脑发育不良的情况下，通常来说就是由于先天因素造成的，在孩子慢慢发育的过程中很难治疗，只能是治标不治本，大脑发育不良的情况下可以带孩子去专业的脑科做恢复训练，从而确保孩子以后的较正常发育。
小孩脑发育不良治疗主要是对症治疗，康复治疗为主，越早治疗效果越好。可以到医院康复科就诊，根据病情采取相应的康复治疗方法，也可以回家自行康复锻炼，包括躯体训练，技能训练，语言训练等。
脑发育不良的症状主要有以下几点：
一，生长发育障碍。轻度的儿童脑发育不良，生长发育基本正常。多数儿童脑发育不良比同龄孩子矮、生长发落后。
二，视听障碍。很多发育不良患儿还有近视、斜视，内斜视最常见。
三，语言障碍。脑发育不良患儿可能伴有语言障碍。
四，姿势障碍。脑发育不良的患儿身体姿态异常、姿势稳定性差，运动或静止时姿势左右不对称，严重的头部无法像正常孩子在竖直正中的位置，喜欢摆在两侧。
小儿脑发育不良的危害如下：
小儿脑发育不良的危害如智力发育障碍，孩子会出现智力低下，听力障碍，发育迟缓。轻者智力可能会接近正常，大多数会有智力低下，不善言辞，出现行为异常，固执，多动症，社交障碍，强迫症等。部分患儿会出现记忆障碍，对新事物缺乏认知能力，注意力，精力难以集中。甚至多言多语或者沉默寡言，动作不协调，情绪失控，易冲动，遗尿等。还可能出现痴呆，偏瘫，全瘫等表现。