掌跖脓包病和汗疱疹的区别是，掌跖脓包病大多数的水泡是属于清亮透明的，但它不是属于银屑病，而这种汗疱疹出现之后，这些小水疱像米粒一样大小，而且还会突出于皮肤表面。汗疱疹一到两周后会逐渐形成皮屑，然后会反复发生。
掌跖脓疱病需与汗疱性湿疹样皮炎鉴别，特别是继发感染而形成脓疱性损害时。但是，掌跖脓疱大部分水疱是清亮透明的。如想确切区分可以做个病理。掌跖脓疱病，病程长，好发中年女性，掌跖红斑上反复发生脓疱，伴不同程度瘙痒，病理变化为表皮内脓疱。汗疱疹症状为深在性小水疱，粟粒至米粒大小，略高出皮肤表面，常无红晕。对称发生于掌跖及指（趾）侧。
