一般均需手术刮除。手术时用睑板腺囊肿夹子夹住翻转的眼睑，使囊肿位于夹子的环圈内，用尖刀切开囊肿，切口与睑缘垂直，用小锐匙将囊肿内容刮除干净，剪除分离后的嚢壁以防复发。如果囊肿已自行穿破，有肉芽组织突出时，除将肉芽组织剪除外，还应将囊肿内容物与嚢壁一起清除干净。
小儿蛛网膜囊肿不严重，建议患者积极治疗。
小儿颅内蜘蛛膜囊肿属于良性疾病，多发生在颞部、后枕部、后颅窝，容易造成脑脊液流通路径阻塞，造成脑水肿，患者可能出现头晕、头痛、恶心、癫痫等症状。一般可以采用囊肿剥离开窗术、显微镜下囊肿剥离开窗术、囊肿腹腔分流术等方式进行治疗，所以小儿蛛网膜囊肿不严重。
患者平时应该不吃或少吃油炸刺激性食物，多吃应季的蔬菜水果，养成定期体检的好习惯，每年或每半年一次，有利于身体健康。
在眼睛囊肿的情况下，可以通过热敷来缓解。如果逐渐变得越来越大，可以通过手术直接移除，手术去当地正规的大医院，因为每个地区的医疗技术都有一定的差异。在平时生活中也要做热敷，同时多吃降火的食物，比如蜂蜜，海带汤，绿豆汤等。
眼囊肿大多是我们通常所说的chalazions。发生在睑板腺，睑板腺是一种慢性炎性肉芽肿。其中大多数是由于管道堵塞和脂肪分泌物滞留造成的，这两者在幼年时就密切相关。通常可以使用热敷，大多数效果很好，也可以局部使用减少汞的白色或黄色眼膏，但大多数效果不是很好。如果发现囊肿本身已经磨损，并且在检查中发现肉芽组织突出，则肉芽组织必须在手术后切除，并且将囊肿内容物和壁一起去除。
小儿脑囊肿可能是由于脑部受到了感染，要及时去医院进行手术治疗，术后要服用一些抗生素，避免感染，平时要饮食上注意清淡，多吃补脑的食物，多吃富含蛋白质的食物，要多注意休息。
