秋季腹泻的疫苗每个季节都可以打，最好不要超过当年的九月份和十月份。秋季腹泻疫苗是二类疫苗，属于自愿和自费接种的疫苗，一般打一次可以维持一年左右的时间，三岁以下的儿童可以每年打一次。
通常来说，秋季腹泻疫苗可以打，但不是必须接种。
秋天接种痢疾的预防措施是降低儿童患上肠炎的几率，临床上最常见的肠道病毒是轮状病毒，通常会有拉肚子症状，大便是鸡蛋花汤，很可能会导致病情恶化，伴有发烧，脱水等症状，接种疫苗后即使是感染了肠道病毒，症状也会相对轻微，通常来说，可以在秋天接种痢疾的预防接种，但并不是必须接种。
儿童秋季腹泻的处理方法如下：
1、对因处理：秋季腹泻主要由轮状病毒感染引起，所以对因治疗并不需要特别处理，也不需要给孩子使用抗病毒药或者抗生素，这些药物对缩短孩子的病情没有任何帮助，只需要等待病毒感染的自然病程就可以了，大部分孩子秋季腹泻病毒感染的自然病程一般在1-2周左右；
2、对症治疗：秋季腹泻主要表现为腹泻，腹泻次数多，量大，每次大便的水分多，秋季腹泻的孩子容易出现脱水的症状，可以给孩子服用蒙脱石散、益生菌、锌制剂等，帮助孩子调整大便性状，减少腹泻和水分的丢失。另外还要保证孩子的摄入量，避免脱水。如果孩子已经出现脱水的症状，比如精神反应差、少尿、无尿、哭时没有眼泪、前突凹陷等症状，一定要及时到医院进行静脉补液治疗。脱水对孩子的影响要比腹泻严重，因此应积极预防脱水，出现脱水时应及时治疗。
母乳性腹泻最好不要接种疫苗。
因为婴幼儿腹泻时，很难分辨是母乳性腹泻还是感染性腹泻，如果是感染性腹泻，那么接种疫苗会导致孩子的免疫力降低，从而导致感染加重。所以如果孩子有了母乳性的腹泻，建议在孩子腹泻症状消失后再接种。乳汁性腹泻，是一种由母乳引起的儿童腹泻，多见于6个月以下的婴幼儿，其临床表现为大便次数多，多则三四次，多则十几次，大便呈泡沫状、水分多、发绿、有酸臭，还可伴有透明粘液。腹泻一般不会出现发烧的情况，患儿不会出现疼痛、哭闹、感染等情况，孩子的精神状况也会好很多，不会影响到孩子的生长发育。
宝宝腹泻是不可以给宝宝进行疫苗接种的，因为时候进行疫苗接种会使宝宝腹泻更加严重，建议等宝宝康复以后再进行疫苗接种，可以给宝宝服用药物进行治疗，平时多喝水，避免脱水。