有20多种肠道病毒导致手足口病，其中最常见的是CoxAsckievirusA16（CoxA16）和肠道病毒71（EV71）。手足口病的感染源是患者和潜伏感染。在流行期间，患者是主要的感染源。患者在疾病发作后1至2周将病毒从咽部排出，并且病毒在约3至5周内从粪便中排出。疱疹液体含有大量病毒，病毒在破裂时会溢出。药物携带者和散发病例是间歇性和流行期间的主要感染源。
手足口病的主要传染源一般是密切接触患者，接触被病毒污染的物品都可能被传染。
比如被病毒污染的手、洗漱用品、贴身用物、玩具、食具，以及床上用品等，都可以引起感染。呼吸道飞沫传播，饮用被病毒污染的水，或者是食用被病毒污染的食物，都可以导致手足口病的发生。手足口病在儿童中高发并不是指成人不会得手足口病，而事实上大人也会感染手足口病的病毒，一般都是隐性感染，成为隐性感染者。成人因为自身抵抗力较强，感染了病毒没什么明显症状，有的人仅有轻微的咽喉痛。这类隐性感染者也是“毒源”，会传播病毒给孩子。
建议家长在手足口病高发期减少和孩子的亲密行为以及做好个卫生以切断疾病的传染。
手足口病是肠道病毒感染引起的传染病，人是肠道病毒的唯一宿主，人对肠道病毒普遍易感。患者、隐性感染者和无症状的带毒者都是本病的传染源，通过密切接触进行传播。病人口咽部的分泌物，可以通过呼吸道飞沫传给其他人。
手足口疾病的主要传染源为病人本人和隐性的感染者。在流行期间，病人为主要的传染源，因手足口病为肠道病毒，它主要经粪口传播、呼吸道飞沫传播，也可经病人皮肤、黏膜上的疱疹液而传染。
儿童手足口病主要是肠道病毒感染，导致急性、传染性、出血性疾病。
肠道病毒的种类多，主要是由肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型引起手足口病，最近流行的手足口病还有柯萨奇病毒A6型。通常手足口病主要是感染5岁以下的孩子，尤其3岁以下的孩子发病率最高，成人较少。手足口病也称自限性疾病，不用治疗可以自愈，小孩要做好防范工作，每年五一以后是手足口病流行的高发季节，会持续到十一左右。主要通过密切接触传播，预防手足口病要在流行的高发季节，避免到人员比较多，较密集的场所，勤洗手，可以接种手足口病疫苗，孩子六个月以上就可以接种，要接种两次，第一次和第二次间隔一个月以上。
婴儿手足口病初期症状通常有低热、全身不适、腹痛等。
一般情况下，手足口病潜伏期通常为3-5天。在发病前，婴儿可能出现的前驱症状有低热、全身不适、腹痛等，此外，婴儿的口腔粘膜上可能出现散在疼痛性粟粒到绿豆大小的水疱，手、足出现斑丘疹、疱疹，初期为斑丘疹，后变为疱疹，呈圆形或椭圆形，比水痘皮疹小，质地坚硬，皮疹消退后不会留下疤痕或色素沉淀，如果再发生感染，会加重皮肤的损伤。需要注意的是，如果有发展为有肺炎、脑膜炎等疾病的趋势，应立刻到医院治疗。