多考虑为消化不良引起，孩子较小，胃肠功能尚未完全发育成熟，容易诱发消化不良，腹泻，便秘的；可以孩子喝点热水，注意腹部保暖，喂奶不宜过饱，母乳喂养，母亲饮食还需避免辛辣食物，生冷食物刺激等。
新生儿不吸母乳可能是因为乳头错觉的原因导致的，一定要在宝宝半睡半醒的时候，或者是新生儿饥饿的时候然吸吮母乳的，基本上一个星期左右的时候，新生儿就吸乳头了。
新生儿母乳喂养拉肚子可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。
新生儿母乳喂养腹泻，通常多因母体饮食不当引起。母乳中含有大量的维生素和蛋白质以及微量元素，这些营养物质都是对宝宝健康非常重要的成分。因此，母乳喂养过程中，妈妈要特别注意饮食，不能随意食用，不然肯定会造成儿童消化功能紊乱，继而发生腹泻。因此在母乳充足时，就应该尽量保证孩子摄入足够的食物，这样才能有效预防婴儿拉肚子。症状严重者，可让宝宝吃妈咪爱或益生菌调理肠胃，那么，平时就应该让孩子喝更多的水，帮助减轻患儿疾病。
新生儿肠胃发育不成熟，消化能力差，喝母乳消化不良也是正常的。
新生儿有消化不良的现象，母乳的妈妈要注意饮食，不能吃凉的、刺激性的、太油腻的食物。喂宝宝前要清洁乳头。注意喂养时间要节制，不能新生儿一哭就喂奶。妈妈要注意保持营养均衡，要摄取糖类、蛋白质、脂肪、维生素、矿物质等营养素，注意钙质和铁质的补充。
通常情况下，如果宝宝不吃母乳，可以通过配方奶来给宝宝提供营养。具体内容如下：
单纯的胃肠道消化不良可以通过服用婴幼儿健脾散和益生菌来进行调理。此外，宝宝出现发热后出现食欲下降的情况，可以用热水擦拭手心、脚心，然后进行物理降温。家长不能盲目觉得患儿冷，而且春季天气多变，更需要注意增减患儿的衣物和被褥，以免患儿过冷或过热。
一般来说，新生儿吃母乳拉肚子可采取以下手段：
新生儿胃肠功能不完善以及刚刚开始接收来自外界的食物，可能会出现拉肚子等胃肠不太适应的症状，适当给予益生菌，可以帮助新生儿调节肠道菌群，改善拉肚子症状。用药后，家长要注意观察孩子的体重情况，大多数情况下是不会有什么问题的。
日常生活中，要让宝宝多休息，保持环境安静，保持室内空气新鲜、流通，室温以20℃-24℃为宜，相对湿度约60%。