如果儿童半夜发烧39摄氏度，可以遵医嘱给其服用退热药物，还可以给其进行物理降温。
儿童神经系统发育不健全，如果儿童半夜发烧39摄氏度，这是比较严重的，可给予退热药物进行治疗，如对乙酰氨基酚、布洛芬等，但需要在医生的指导下进行。在服用相关药物后，家长需要对儿童进行物理降温，如给儿童贴退热贴，用温水把毛巾打湿，给儿童擦身子，这样有利于降温。
儿童半夜发烧一般可以通过日常护理、药物治疗等方式缓解症状，通常没有最有效的说法，具体内容如下：
1.日常护理：儿童半夜发烧如果症状较轻，需要注意饮食健康，不吃生冷刺激的食物，保持饮食清淡，可适量地饮水，避免水电解质紊乱，还可通过擦拭身体的方式进行退热治疗。
2.药物治疗：但如果症状较为严重，还伴随有头晕、咳嗽等症状，家长可在医生指导下给儿童使用头孢克肟、阿莫西林、布洛芬等药物，进行抗炎杀菌处理，避免病情加重，能够有效地缓解症状。
通风散热，但是那一定要多注意通风散热，而且衣服不能穿得过于紧，也不能用被子裹住孩子，尤其是在夏季的时候可以使用空调，但是温度要控制在27度左右才行。另外要注意给孩子多进行补水，也可以给孩子喝一些果汁，比如西瓜汁，就是非常不错的。
宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
儿童体温38.5度，属于发烧，应及时减少所穿的衣物，处于凉爽、舒适、通风的环境之中。适量多饮水，以免出现因发热导致脱水的情况。发热时，如果手脚冰冷伴有寒颤，可以用温水泡手、泡脚，也可以进行温水浴。
