婴儿期的肛周脓肿一般采用切开引流的方式，创伤不大，切开引流后，只要脓肿的引流通畅，脓液排除以后，绝大多数的患儿都可以治好。一般不会形成肛瘘，也有极其个别的婴儿会形成肛瘘。后期肛瘘治疗，婴儿的脓肿只需要切开引流，引流通畅即可。
婴儿肛周脓肿的治疗，肛周脓肿在婴儿中还是比较常见的疾病，肛周脓肿发现很早，只是红肿，还没有完全化脓的下，也就是说没有明显波动感下，若已经化脓，也就是说有了波动感，只能是手术治疗，就做个肛周脓肿切开引流就可以了。
小孩肛周脓肿建议及时就诊，通过抗感染进行治疗。
小孩的肛周脓肿如果发病时间比较短，还没有形成明确的脓腔，这种情况下一定要积极的就诊，通过抗感染治疗，因为小孩一般不使用药物治疗，所以建议静脉输注抗生素，或肛周脓肿表面涂抹抗生素。如果小孩的肛周脓肿已经明确形成脓腔，建议积极的手术治疗。一般可以做肛周脓肿切开引流术。
肛周脓肿的治疗方式主要是进行药物治疗。新生儿出现肛周脓肿是需要尽快进行治疗的，否则肛周脓肿严重是会导致肛门周围发生感染炎症，进而导致出现痔疮直肠癌的可能。一定要定期到医院进行复查，以免发生感染。
婴儿容易感染肛周脓肿，患直肠炎、便秘、身体虚弱的人群也容易感染肛周脓肿，婴儿患肛周脓肿具体处理方式如下：
若婴儿有肛周脓肿，并且反复破溃流脓，通常不建议选择手术根治术，建议用肛周脓肿切开引流术，此时切口要够大，否则会出现早期愈合但反复出脓的情况。创面大要每天换药，这对于康复是很重要的，每次换药一定要彻底，避免皮肤形成假愈合的情况。
婴儿肛周脓肿自己破了可以先观察。要注意局部的清洁干燥，用碘伏擦拭消毒，或者到儿外科就诊做一下身体检查，看是否有脓液，如果有脓液需要就采取引流治疗，另外根据病情采取消炎药治疗。