宝宝摇头晃脑的原因有主要是因为缺钙和缺少维生素引起的，补充维生素和钙剂就会缓解。大一点的宝宝摇头晃脑的原因，首先要排除儿童多动症，儿童多动症现在比较多见，多见于4-10岁的宝宝，除摇头晃脑之外，还有挤眉弄眼、做鬼脸等。除此之外，宝宝摇头晃脑还见于缺少微量元素。
宝宝摇头晃脑，常见以下几种情况：属于正常现象，多见于6月龄左右的宝宝，此时随着大运动及大脑皮层逐渐发育完善，宝宝可以自主控制头部运动，从而出现摇头晃脑，并伴有欣喜表情，多数无大碍，家长不要过多关注、逗引，否则会加重此现象。维生素D缺乏性佝偻病，除摇头晃脑外，多伴有枕秃、多汗、夜惊。
通常情况下，宝宝睡前摇头晃脑可能是睡眠环境不佳、缺钙等导致的。具体分析如下：
如果宝宝睡前摇头晃脑，可能是因为睡眠环境不佳，比如室内太炎热，导致头上出了很多汗，从而出现睡前摇头晃脑的情况；此外，如果宝宝身体缺钙，还会引起摇头晃脑，并且有枕秃，惊醒、惊跳、哭闹，并且夜间汗多等情况，所以宝宝睡前摇头晃脑可能是缺钙导致的。
小宝宝摇头晃脑有多种原因，一岁以内的小宝宝摇头晃脑，主要是因为缺钙和缺少维生素D引起的，补充维生素Ｄ和钙就会缓解。大一点的宝宝摇头晃脑的原因，首先要排除儿童多动症，除此之外，宝宝摇头晃脑还见于缺少微量元素。
属于脑神经功能紊乱，帕金森的症状，属于先天遗传因素所致的脑神经发育异常的情况，属于内分泌失调的症状，属于缺钙缺钾的症状，如果各项检查结果正常，身体没有不适的感觉，就问题不大处理，一是不吃辛辣刺激食物，二是多喝汤水，多吃蔬菜和水果。
当孩子出现不自觉的摇头晃脑，有时还会伴有眨眼，耸肩等行为时，就应该引起重视，孩子很可能是患了神经性抽动症的表现。这是属于运动型抽动的一种表现形式。如果得不到及时治疗还会出现，耸肩，摇头等异常行为，长期得不到治疗，会对孩子的心理造成影响，出现自卑、自闭等心理问题。