儿童出现肛周脓肿的时候，要及时的治疗，可以采用局部用药治疗的方法进行治疗，轻柔按摩包块，慢慢促进药物吸收。要注意让孩子多吃些新鲜蔬菜水果，可以有助于提高抗病能力。
对于肛周脓肿，西医常用的是抗生素，可以通过口服或者静脉点滴来进行治疗。
对于肛周脓肿，可以在浅浅的地方涂抹，如果是在皮肤比较浅的地方，那么就可以进行手术。反之，局部脓肿不是消失，而是扩大，或者是软化，就是已经形成了脓液，可以通过切口排脓。对于小儿肛周脓肿，父母要立即送到正规的医疗机构进行正确的处理，以促进病情的好转。上述药品需要在医生的指导下服用。
小儿肛门脓肿主要就是切开引流，切开后要多清洗，一但肿块起来，最简单的方法是用注射器针头直接扎破，脓流出来就好了，多清洗，小儿的肛门脓肿有自愈的可能，时间长了不愈合就成了肛瘘在肛肠疾病是很常见的，这种问题了，成为肛瘘在肛肠疾病是很常见的，这种问题很难预防的，随着生长，体内的激素的逐渐减少，一部分可以愈合的。
少数肛周脓肿用药物，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，单纯性脓肿的治疗可在截石位或侧卧下，用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后，伸入食指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许，以利引流，最后用纱条放入脓腔做引流。
初期肛周脓肿可以选择有效的抗生素治疗。肛周脓肿多由肛腺感染经内外括约肌间隙向下经外括约肌皮下部向外扩散而成，常位于肛门周围皮下部。局部可见肛门边缘皮肤红肿，伴硬结和触痛，后期可有波动感。
肛周脓肿想要治好需要找到内口，治疗内口，后期饮食注意就不会在复发，一般只切开排脓是达不到效果，去正规的肛肠医院检查治疗。不要过食辛辣，过度饮酒，注意个人卫生。还要忌食生冷之物及油腻之品，以防发生腹泻或粪渣堵塞肛窦。