儿童生殖器疼病因一般有两种。
1、泌尿系统感染时，因患儿有生理性包茎，感染不易被察觉，推荐做小便常规检查，然后进行抗感染治疗。
2、部分儿童可能会出现泌尿系统结石，引起生殖器疼痛。建议加重带着孩子到医院通过超声、ct等检查，然后合理治疗。
此外，家长应该注意让儿童保持良好的行为习惯，避免摩擦、抓挠生殖器。
儿童生殖器发育迟缓考虑是包皮过长，但有不少人到了成人时期包皮仍较长，只要经常注意卫生，把包皮翻起进行清洗，不让污垢堆积在里面，就既不会影响健康，也不会影响性功能。
儿童的皮肤比较娇嫩，容易出现湿疹，尤其是在天气炎热的时候，如果穿的太厚，或者让生殖器长期闷着就容易出现湿疹。所以平时要注意宝宝生殖器的卫生清洁，让宝宝穿宽松透气一些的棉质内裤。
幼儿得了这种病，大多数是经过母亲的产道的时候与母亲密切地接触直接感染的，如果要是想要治疗，可以采用中医的方法，先到医院里面先看一下孩子的情况到底是怎么样的，到底是严重还是比较轻一些，根据医生的建议而采用中药的治疗。
儿童生殖器疱疹可以挂皮肤科或者泌尿外科。去医院完善检查，明确诊断，在医生的指导下选择治疗方案。可以每天用清水清洗生殖器部位。当出现局部的感染后，要及时用消毒水清洗局部，避免局部的搔抓，不可用刺激性太强的药品。
儿童生殖器红肿，大多数是由细菌感染导致的。局部的疼痛会引起小孩哭闹，用碘伏来消毒处理。平时一定要保持包皮及龟头的清洁卫生。在炎症治疗好下，一定要经常翻起包皮来清洗，每天清洗1次，这样可以有效地预防包皮龟头炎再次感染。
