婴儿肛周脓肿症状主要是出现肛周持续性剧痛，婴儿受压、咳嗽后会出现症状的加重，导致婴儿在生活之中出现哭闹不安，食欲不振的问题，而且对于婴儿的正常睡觉、睡眠等均是具有一定影响的，因此婴儿出现这些症状之后要及时的就医检查。
该病的出现导致患儿的肛门部位疼痛严重，发病初期为胀痛，出现化脓时会出现跳痛的症状，特别是在排便时患儿的疼痛会明显加重，脓肿会在肛门前方产生尿潴留，且在肛门后方产生尾骶部疼痛的症状。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
早期症状主要表现为肛周肿物隆起、色淡红、皮温高、伴疼痛、发热，这是感染化脓性疾病，有的脓肿可出现破溃、流脓。之后疼痛症状会减轻，破溃口会间断的分泌分泌物，肛周脓肿也会再起，反复发作。
