小儿慢性肠炎可以通过饮食和药物来进行调理。
1、饮食调理：宝宝平时要吃清淡易消化的食物，可以多吃小米粥、烂面条、鸡蛋羹等，帮助消化，缓解肠胃的不适。父母不能强制孩子吃东西，要按时、定量地吃。
2、中药调理：小儿康颗粒、醒脾养儿颗粒、加味保和丸等都是可以治疗小儿脾胃的疾病，但是要在医生的指导下使用，尽量不要擅自使用，以免出现副作用。
由于孩子正处在身体的发育期，因此食物还要富有营养，可多吃一些如牛奶、鱼类、豆制品类、面条、新鲜蔬菜和水果等。另外扁豆等也可以起到对胃部消化的功能，这些都是家长为孩子比较好的选择。还要注意在饮食上可以多吃清淡有营养的食物，注意饮食卫生。饮食上应安排无渣、软食、易消化、营养价值高的食物为主，长期腹泻给孩子会带来一定的精神压力，还会因此而引致失眠。所以要创造良好的小环境。
一般情况下，慢性肠炎可以通过药物治疗、生活护理来调理，具体内容如下：
如果是慢性肠炎，可以服用一些具有调节肠胃、促进消化、涩肠止泻的功效的中药，用于治疗慢性肠炎。患有急性胃炎的患者，日常生活中要以清淡为主，避免食用辛辣刺激的食品。平时要多吃一些清淡的食物，要多加保暖。吃一些辛辣刺激的东西，吃烧烤、油炸食品都会导致肠道炎症加剧。
慢性肠炎的患者少吃食用纤维高的食物，如萝卜、芹菜、白薯、生蔬菜、水果以及粗杂粮、干豆类等。具体内容如下：
养成良好的生活习惯，严格戒烟、禁酒。吸烟和饮酒可加重肠炎的病情，应绝对避免接触。饮食管理，避免暴饮暴食及食用难消化、刺激性食物，以免增加肠道的负担。急性活动期可流质或半流质饮食，病情好转后改为高营养、易消化的少渣饮食，不宜过于辛辣。注重饮食卫生，避免肠道感染性疾病。肠炎恢复期，此时肠道病理生理向好的方向转变，对食物非常敏感，因此要特别注意节制饮食，宜吃些清淡，软烂，湿熟食物。
宝宝会开始出现腹泻以及频繁恶心呕吐的情况发生，并且，腹痛剧烈，腹泻次数多，而且多是水样便，带有未消化的食物，这是最为常见的现象；在平时生活中需要妈妈们及时的照顾到宝宝的细节，注意观察宝宝有无一些不健康的表现，比如：食欲下降、经常性的出现一些痛哭、或者是经常性的出现一些腹泻、身体上出现一些发热等。
过敏性结肠炎：若患儿对牛奶蛋白过敏，且为母乳喂养，则其母亲需忌食牛奶、鸡蛋、海鲜等，可补充钙粉、维生素D等；配方奶喂养导致的过敏性结肠炎，可选择低敏配方奶粉。不宜食用油炸、油腻、辛辣的食物，还可补充奶制的食物。