慢性肠炎主要症状无特异性，多数有不同程度的消化不良症状，主要有反复性的腹部胀痛，疼痛部位不确切，通常发生在饭后，大便稀薄并带有黏液，有的甚至带有少量脓血，排便次数增多，每日2次到3次或更多。
慢性肠炎可能有以下症状及治疗方式：
慢性肠炎的临床特征是下腹部的坠胀痛，通常在感冒、贪吃凉之后会加剧，常伴有腹痛、粘液便等。可以在医生指导下服用阿莫西林颗粒、左氧氟沙星片、磷酸奥司他韦胶囊等药物进行治疗。在服用药物之前患者需要定期去医院做个便常规检查，以确定是否存在致病菌，可以结合服用抗生素进行抗炎处理。
幼儿得了慢性肠炎会有便秘，腹泻或者是两者交集的情况，腹疼，大便稀薄，不同的孩子还会有些不同的症状，孩子出现症状，要注意尽早给孩子检查和治疗，用肠道益生菌来改善情况，注意母乳喂养的，母亲不要吃辛辣刺激的和生冷的。
婴儿患有慢性肠炎，临床表现一般有发热、腹痛、腹胀、腹泻等症状，主要是由病毒、细菌感染引起，需要进些相应的抗病毒、抗细菌治疗，可以给宝宝口服抗病毒治疗，联合口服抗细菌治疗。
大便次数增多，会出现腹痛，其次有嗳气、早饱、恶心、泛酸。进食硬、冷、辛辣等食物或受凉、气温下降时，可引发或加重症状。部分患儿会出现食欲不振、乏力、消瘦及头晕，伴有胃糜烂者可出现黑便。
慢性肠炎的症状是经常出现严重呕吐和腹泻，常连带有腹部痛性痉挛及绞痛、发烧、出汗。饮食不要吃辛辣生冷油腻刺激性的食物，注意清淡饮食，注意保暖，不要吃凉的生冷的瓜果。