雌二醇凝胶和雌三醇乳膏有组成成分不同、主治病症不同等区别。
1.组成成分不同：前者主要由雌二醇组成，后者的主要成分是雌三醇。
2.主治病症不同：雌二醇凝胶可以用于治疗绝经期综合征，比如潮热、出汗、失眠、急躁等症状，对雌激素水平下降的患者有预防尿钙丢失、保护骨量、减少骨质疏松发生和降低骨折率的作用。雌三醇乳膏可以用于治疗雌激素缺乏引起的泌尿生殖道下部萎缩，还可以用于可疑的萎缩性宫颈涂片辅助诊断。
建议在医生指导下用药，不可以私自用药，以免产生不良影响。
若过量使用这种药物，通常出现乳房或腹部肿胀，焦虑不安和易怒现象。这种药物可以用于绝经期综合症如潮热，出汗，失眠，急躁等症状，各种原因所致卵巢功能失调，雌激素水平低落。
雌二醇主要的作用是促进子宫内膜的增长，在怀孕初期为受精卵着床和胚胎生长发育提供良好的环境。如果雌二醇偏低，内膜过薄或是增长缓慢，就容易引起早产的流产。雌二醇下降需要注意观察胚胎发育状况，如果没有异常可以不做处理。
雌二醇乳膏就是雌激素局部外用药，外用它可以改善泌尿生殖道由于雌激素水平下降引起的局部疼痛，瘙痒，干裂等症状。作为雌激素的补充剂，适用于与绝经有关的症状的对症治疗，如潮热、多汗、阴道干燥等。
主要用于月经紊乱、提前停经、整体状态早衰、潮热盗汗、失眠健忘、阴道干涩、性生活疼痛、反复性阴道炎、外阴干裂病变、子宫脱垂、皮肤松弛萎缩、肌肉关节疼痛等，与孕激素联合使用建立人工月经周期中用于补充主要与自然或人工绝经相关的雌激素缺乏。
