卵巢囊肿有生理性和病理性，生理性不用治疗，几周后可自行消失，病理性超过5.0cm可手术治疗，如果不手术很容易发生卵巢蒂扭转，对以后生育也有一定的影响。如果囊肿不大，暂时可以不用手术，做好定期复查，超过5.0m可能在做手术，可以做腹腔镜手术，创伤小，恢复快。
介于良性和恶性之间的卵巢囊肿称为交界性卵巢囊肿，又称低恶性潜能肿瘤，有向恶性转变的可能，但也可向良性转变，通常交界性卵巢囊肿其预后较好，对于尚未生育的年轻病人可以行保留生育功能的手术。卵巢交界性治疗方法是微创腹腔镜联合手术治疗，复发较少。
卵巢囊肿的主要症状表现为下腹不适感，下腹或骼窝部充胀、下坠感。按腹部而发现腹内有肿物，感觉腹痛，月经出现紊乱，囊肿若发生扭转，则有严重腹痛腹帐、呼吸困难、食欲降低、恶心及发热等。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。
卵巢切除手术，这应该是可以治疗好的，手术是彻底治疗卵巢囊肿的方法，药物治疗一般只有控制才能彻底治疗。大多数人不会复发，当然也有少数人会复发，所以术后定期检查，注意休息，保持好心情。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
