巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经，尤其是会出现性前时疼痛出血，最大的危害就是导致女性不孕。如果发现反复腹痛及囊肿增大，需要手术切除。可以医院妇科检查明确，在治疗期间不用有性生活，平时多注意局部卫生。
一般呈褐色，巧克力囊肿又叫做卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。子宫内膜是生长在子宫腔内的，受体内女性激素的影响，每月要脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随着经血逆流经过输卵管进入到盆腔，种植在卵巢表面或者盆腔的其他部位形成异位的囊肿。
巧克力囊肿是子宫内膜异位引起的，每来一次月经子宫内膜脱落，巧克力囊肿都会有一些变化的，巧克力囊肿会引起继发性痛经，那么平时就要注意，不要猛起猛蹲。避免扭转，不要激烈运动。
巧克力囊肿是可以进行治疗的。巧克力囊肿可以配合中药来进行内分泌的调理，达到活血化瘀的效果。平时要注意保持清淡饮食为主，忌食辛辣刺激性食物和过于油腻的食物，注意戒烟戒酒。也可以使用手术进行治疗。
巧克力囊肿彩超有子宫脱落不良的特征，巧克力囊肿会出现小腹肿胀，浑身无力，精神不佳，食欲不振等特征，有可能是遗传引起的一种疾病，当外界因素不良的时候也会引起巧克力囊肿，日常生活中要少去一些潮湿阴冷的环境活动，少去一些有化学物的环境活动。
巧克力囊肿常伴有原发、继发不孕史或继发性痛经，或有不明原因的盆腔疼痛和性交痛等。去内诊检查，囊肿下缘有明显的触痛。腹腔镜检查是诊断最可靠的方巧克力囊肿法之一。因此可以通过有效的检查手段到专科医院明确病因后对症治疗以免延误病情。