多囊卵巢和卵巢囊肿相比，多囊卵巢更为严重。是因为多囊卵巢属于内分泌疾病，常常是由于遗传因素和环境因素相互作用导致的，由于卵泡不能正常生长发育和排出，因此就会导致女性出现月经失调、面部痤疮，甚至肥胖等其他并发症，还可能影响女性的生育功能。卵巢囊肿可能是生理性囊肿，也可能是普通的卵巢囊肿，或者是子宫内膜异位症导致的卵巢巧克力囊肿这些疾病通过手术治疗以后往往都可以治愈，而且不容易影响女性正常受孕。
多囊卵巢综合症的病因可能是肾上腺机能亢进、高胰岛素血症和胰岛素抵抗、遗传等。
1、肾上腺机能亢进：肾上腺分泌旺盛，可能会引起高雄激素血症，导致毛发增多，肥胖；
2、高胰岛素血症和胰岛素抵抗：胰岛素的合成降低会降低血糖的吸收能力，从而产生胰岛素代偿，导致高胰岛素血症；
3、遗传性因素：多囊卵巢综合症，如果母亲或祖母是患者，子女易患病，并有家族聚合性。
引起卵巢囊肿的原因主要以下几个因素：遗传因素，20%～25%有家族史；内分泌因素，临床上很多基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素，而雄激素的过量产生是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果；此外还有生活方式因素以及环境因素。
胎儿多囊肾可能是遗传导致的。
多囊肾脏是一种与基因有关的隐性遗传疾病。多囊肾的胎儿一般都有家族性，因此胎儿多囊肾可能是遗传导致的，可以在早期进行B超的诊断，如果胎儿出生后出现囊肿爆裂、血尿、腰痛、肾功能不全等情况，要进行针对性的治疗。日常生活中要多注意多休息，多食用一些新鲜的蔬果，多运动，以维持良好的情绪。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
如果比较严重是会对受孕造成困难的，但是如果病情不是特别严重，有发育成熟的卵泡也是可以自然受孕的，多囊卵巢综合症是由于体内激素水平异常造成的卵子多，但是没有发育成熟的卵泡，有可能还会出现多毛痤疮，月经不调，身体肥胖等情况的。
