直肠子宫内膜异位症可能是经输卵管转移、经期同房、经期剧烈运动等原因引起的。
1、经输卵管转移：在月经期间脱落的子宫内膜碎屑可随经血倒流入输卵管，然后由伞端溢出，移植于盆腔腹膜、卵巢等组织的表面，继续生长，最后发展成为子宫内膜异位症。
2、经期同房：经期同房可促进经血逆流，诱发直肠子宫内膜异位症。
3、经期剧烈运动：月经期间运动比较剧烈，也可导致经血逆流，诱发直肠子宫内膜异位。
子宫内膜异位症的发病原因至今没有发现，主要学说及发病因素有异位种植学说，体腔上皮化生学说，诱导学说，遗传因素，免疫与炎症因素等。子宫内膜异位症有下腹痛和痛经，不孕，性交不适，月经异常的现象。
子宫内膜异位症，最常见的症状就是有痛经的情况。主要是跟过多的人流，过多的生产以及经期性生活都有一定的关系。如果存在有子宫内膜异位症可以以自己的生育需求情况，使用药物进行控制。
子宫内膜异位症引起的原因比较多，由于经血的逆流，宫腔和输卵管是相通的，由于在来月经的时候子宫内膜腺上皮和间质细胞可随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植于卵巢和邻近的盆腔腹膜。遗传的因素，如果家族史里面会存在有子宫内膜移位的疾病，那么发病几率比无家族史的人高出七倍。免疫和炎症的因素，由于自身的免疫细胞产生一些变化，各个环节就会产生一些变化，而造成有子宫内膜移位症的发生。
子宫内膜异位症是在多次的人工流产或是有刮宫，或者是分娩，剖宫产的时候引起的，还有就是在月经期，剧烈的运动，或者是阴道流血，月经期的时候同房，使子宫内膜异位到子宫腔以外的部位下会引起。
子宫内膜异位症的病因至今仍然没有明确，比较经典的说法异位内膜种植学说，它的意思是子宫内膜随月经血流或者因为手术到达身体的其它部位继续生长。临床上发现子宫内膜异位症的病人往往有家族聚集性，提示和遗传有一定的相关性。现在越来越多的证据提示，病人的自身免疫功能缺陷是引起子宫内膜异位症很重要的原因。