巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
巧克力囊肿穿刺手术主要是在彩超引导下使用穿刺针经阴道后穹隆刺入巧克力囊肿内将液体吸出来。手术并不是很大，但是手术之后巧克力容易复发，而且容易造成巧克力囊肿在穿刺部位种植导致内异症的发生。
巧克力囊肿穿刺是在超声的检查下进行的手术。巧克力囊肿光是做穿刺是不能达到治好的作用，只是一时让囊肿变小而已，卵巢巧克力囊肿首选手术治疗。如果巧囊位置偏下，可试行穿刺术，但穿刺后巧囊极易复发，对妊娠率提高效果不显著，建议行腹腔镜探查术，术中行双侧巧克力囊肿剥除术，术后尽快怀孕的，一般是需要住院治疗的。
巧克力囊肿是一种比较常见的妇科疾病，多见于年轻女性。巧克力囊肿的患病原因很多。主要是由于子宫内膜异位所引起的。同时与外部因素、遗传因素也有一定的关系。因为巧克力囊肿早期并无明显症状，巧克力囊肿采取穿刺抽液术，虽然可以比较大的程度保留生育功能。是二次复发的风险也比较低。一般半小时内就可以解决了。
巧克力囊肿穿刺术后要暂时注意休息，暂时一两周之内不能同房，另外要用点消炎药，防止感染，尽量不要吃辛辣刺激的食物，其它饮食跟平时正常差不多。卵巢囊肿虽然容易恶变，但只要做到早检查、早发现、早治疗还是可以避免的。
超过5厘米有扭转而导致肌肤症的风险，需要尽早的做手术治疗手术以后做病理检查。对于小于8厘米的巧克力囊肿可以进行药物治疗，使其缩小至完全消失。而对于较大的则以手术治疗为先，可以先使用药物治疗下。
