肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
肝内胆管结石不能自愈，需要系统进行医学治疗，多继发于胆道系统感染或者有胆道蛔虫的病史，以及外伤之后导致的胆管损伤，或者先天性发育异常，有解剖胆管变异，容易导致胆汁淤积，继发形成结石。
肝胆管结石病容易引起右上腹部疼痛，恶心呕吐，服药效果不好很难恢复排出结石，恢复比较慢等，再就是注意饮食作息规律，不要吃太油腻食物和不要喝酒，避免暴饮暴食等以免刺激加重不适症状。皮肤黄疸，严重有可能影响肝功能不好，治疗是手术治疗取出结石。
胆管结石容易导致急性发作，容易出现寒战高热、恶心等，可以先采用些消炎、解痉止痛的药物治疗，如果结石比较大，可以进行手术治疗，结石比较小，没有明显的梗阻症状，也可以暂时先观察。
胆道结石术后常规放置腹腔引流管，主要是用于观察腹腔手术范围内的渗血情况和有无胆瘘。一般在术后的3-5天内引流液相对清亮，大约在10ml左右，即可拔除。术后前几天腹腔引流量相对较大，引流液多为术中渗血，随着时间延长，渗血逐渐减少。