症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗；有生育要求的轻度明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术；年轻但无生育要求的重症可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗；症状及病变均严重的无生育要求可行手术。
卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。可以多吃新鲜的水果和蔬菜，不宜吃辛辣刺激性食物，清淡为主。多吃些富有营养的食物比较好，合理的膳食搭配不仅有素，还有荤菜。
组成针对这一疾病治疗的特色方案--俞氏内异方组，内服、灌肠、局部冷热敷贴等内外治结合。可在消除或控制包块生长的同时，提高而不是抑制病人的卵巢功能，同时能够调节病人卵巢轴功能，使病人体内适合囊肿生长的环境得到纠正，来防止复发的风险。而且对于不孕病人和从保护病人生殖健康的角度看是有意义的，在治疗期间病人的卵巢功能并不会因用药而受到抑制，相反可能有改善作用，这对卵巢的排卵功能、受孕能力等都是有益的。
巧克力囊肿病人应多吃含有丰富膳食纤维的食物，比如芹菜、韭菜、白菜、萝卜等。膳食纤维能刺激肠道蠕动，增加排便次数，从而减少粪便在肠壁停留的时间，减少有害物质的吸收。另外，平时多注意休息，良好的生活习惯也是必要的。
卵巢巧克力囊肿是一种疾病，具体分析如下：
卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位在卵巢深处，经血无法及时排出，从而滞留在卵巢中，形成了一个囊肿，这种囊肿一般都是巧克力糊状，也就是所谓的卵巢巧克力囊肿。卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位所致，会出现痛经、月经紊乱等情况，甚至会出现不孕的情况。卵巢巧克力囊肿的治疗方法有两种，一是保守治疗，二是手术，如果病情不是特别严重，可以口服激素类药物。
有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
