胚胎停育没有明显的先兆，有可能会在做产检的时候无意中发现。怀孕早期胚胎停育，如果有早孕反应比较严重，胚胎停育以后会减轻早孕反应或者没有早孕反应症状。如果早孕反应比较轻，孕妇没有明显的症状，所以不会有胚胎停育的。
胎停育临床症状是一般先有腹痛，然后阴道出血，有时是褐色分泌物。孕吐、乳房胀痛等突然停止很可能是胎停育的征兆，不放心可以检查B超。孕早期反应也是因人而异的。有的人反应不强烈，只要孕期检查没有异常的情况，一般是没有问题的。
些妊娠反应，例如孕吐、乳房胀痛等突然停止，也很可能是胎停育的征兆。首先，恶心、呕吐症状消失。在怀孕初期，出现孕卵停止发育的表现，有的有腹疼和流血，有的突然停止早孕反应，有的没有任何反应，阴道少量咖啡色或者粉色阴道出血。
当胚胎停止发育后孕妇的早孕反应会逐渐消失，比如恶心、呕吐、嗜睡等现象都会逐渐消失，部分孕妇可能会见红。而与先兆流产有区别的是孕妇在胚胎停育的状态下，一般不会出现腹痛的情况，孕妇要观察自己的身体状态。
胎停育就要做全面检查，抗体检查放在最后，重点放在黄体功能、TORCH和肾脾功能，改变不良生活方式。要把检查的重心放在精子和卵子上面，通常空囊是由于精子质量不好，受精卵受到强辐射造成的。