子宫内膜异位症在体内雌激素水平降得非常低，以至于接近没有的时候，它可能会自愈。更年期以后或到绝经期以后，当雌激素降低至原来的五分之一以下，就有自愈的机会，因为那个时候就绝经了，卵巢功能衰退，如果不是这种情况，一般没有自愈的可能。
能治好。可采用药物治疗，年轻的女性有痛经，查体，盆腔无明显包块，给予短效的口服避孕类的药；保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。
彩超是可以查出子宫内膜异位的，也会查出子宫巧克力囊肿的，巧克力囊肿是与子宫内膜异位有关的。需要检查确诊，如果是巧克力囊肿是可以到当地的正规的医院检查手术进行治疗。
子宫内膜异位症是由于活跃的子宫内膜应该在子宫中存活，但子宫内膜异位症存在于骨盆的其他部位。可能会出现痛经，月经不调，不孕和性交疼痛等症状。诊断可以通过妇科彩色多普勒超声或腹腔镜检查确认。较轻的可以用药物治疗，重量通常用手术治疗。
手术与药物联合治疗：手术治疗前给予3-6个月的药物治疗，使异位病灶缩小、软化，有利于缩小手术范围和手术操作。对保守性手术、手术不彻底或术后疼痛不缓解者，术后给予药物治疗，推迟复发。保留生育功能手术：切净或破坏所有可见的异位内膜病灶、分离粘连、恢复正常的解剖结构，但保留子宫、一侧或双侧卵巢，至少保留部分卵巢组织。适用于药物治疗无效、年轻和有生育要求的患者。
根治性手术：将子宫、双附件及盆腔内所有异位内膜病灶予以切除和清除，适用于45岁以上重症患者。保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。
