输尿管镜取石术发生并发症，穿破输尿管或者造成狭窄。结石直径超过1厘米或者是表面粗糙呈多角形正。结石嵌顿过久输尿管发生严重的梗阻及上尿路感染。需要开放手术取石。
输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。要根据输尿管的具体位置来制定，一个是从腰部做切口，另一个是直接从尿道植入输尿管镜。也可以采用经皮肾镜碎石取石，这其中也包括气压弹道、超声碎石、钬激光这些媒介方式，输尿管下段的结石可以采用经尿道输尿管镜下碎石取石。
输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。输尿管镜手术，通过输尿管软镜技术将输尿管或肾中结石取出，不适用于较大的结石；经皮肾镜手术，从腰上肾的部位打一个小孔，直到结石部位，通过特殊的器械和方法，把结石打碎，从小孔取出。体外冲击波碎石，又称微波碎石或震波碎石，是较常用的方法，具有花费小、损伤小、恢复快和费用低等优点。
输尿管结石在泌尿外科来说是比较常见的一个疾病，主要症状一般是以肾绞痛为主要表现，往往是突然发生肾区绞痛，而且疼痛是十分剧烈难以忍受，往往会向四周放射，比如放射会阴区，还有就是男性可以放射的睾丸、阴茎，女性可以放射到阴唇，还有就是伴随着有恶心、呕吐的症状。
有些可能是碎石之后，比较小的结石一两天就排完了。有些可能要十天，甚至半个月或者半个月以上，才可能排完石。当然也有一部分人存在输尿管狭窄的原因，即使碎了石，也不能完全排出。往往就需要进行手术，来辅助排石。
可以吃一些具有清热解毒，利尿通淋作用的中药，对输尿管结石的治疗也是有一定帮助。输尿管结石单纯的使用中药治疗效果就不理想，这时候大部分病人需要进行手术治疗。