精子畸形率高得看有多高，正常男性精子中也存在异常精子，不过一般不超过百分之三十，一般精子畸形率高于百分之五十，就属于高畸形率了，就会影响怀孕，会引起不育。影响精子畸形的原因有很多，比如酗酒，抽烟，熬夜都会有一些影响，还有就是环境等，养成良好的生活习惯，如果还是不能正常受孕的要接受治疗。
精子对于男性的生育以及其他性行为很重要，体内精子要有动力，且形状不能发生异常。畸形精子过量会影响生育，比如双头精子。精子质量十分不好，不利于生育；生养正常的宝宝，要求男性精子质量好，即使在生活、环境差的情况，也要保持精子高质量，减少畸形精子的发生。
畸形精子对正常的怀孕影响还是比较大的，这时候怀孕有可能会出现胚胎停育，严重会出现流产现象。进一步做一下精子形态学和生精细胞学等检查，查明具体导致精子质量下降的原因，依照调查结果积极接受治疗，可以考虑进行人工授精，通过人工授精进一步筛选成活率高的精子从而达到怀孕的效果。
一般情况下，畸形精子怀孕不是畸形。具体情况分析如下：
男性精液中存在畸形精子，正常情况下，正常情况下男性会出现这种情况，正常情况下不超过60%就可以正常怀孕，而且怀孕后胎儿不会出现畸形，因为受孕是精子快速向前活动，与卵子结合的过程。但是胎儿畸形与其他因素有关系，需要定期进行产检，比如怀孕期间服用药物导致胎儿畸形，或者服用放射性物质。
起畸形精子的原因有很多，因此畸形精子症的治疗要消除不利因素（药物、放射线、高温、酒等），针对病因进行治疗。由生殖道感染引起畸形精子症的，可进行抗炎治疗；由内分泌异常所致畸形精子症，则给予内分泌功能调整；对精索静脉曲张引起畸形精子症的，应考虑手术治疗。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。