膀胱结石的最佳治疗方法大体上两类，一类为手术取石，一类为非手术碎石，其中手术取石即传统的耻骨上膀胱切开取石术，另一类的非手术碎石则又可分为膀胱镜机械碎石大力钳碎石、液电效应碎石、超声碎石、弹道气压碎石等。
膀胱结石外科治疗的方法包括内腔镜手术、开放性手术和体外碎石术。内腔镜的治疗：经尿道膀胱镜结石的治疗方法是目前治疗膀胱结石主要的方法。方法的优点，它可以直观、直接的碎石；可以同时处理下尿路的梗阻性疾病，比如说尿道狭窄、前列腺增生。目前使用较多的是钬激光碎石术：一个是可以治疗结石；第二个可以治疗引起结石的其他的疾病，如尿道的狭窄、前列腺增生等情况。
治疗可采取尿道镜取石术的措施，尿道狭窄阻碍结石排出或结石嵌顿严重者，可经尿道镜在窥视下先切开狭窄段再行取石。结石大而嵌于尿道时间久者，可在内镜下行气压弹道碎石或激光碎石。
膀胱结石是指在膀胱内形成的结石，分为原发性膀胱结石和继发性膀胱结石，对于膀胱结石的治疗原则是取净结石，纠正结石成因。选择在膀胱镜下进行碎石手术。膀胱感染严重时，应用抗生素治疗。
可以通过彩超检查判断膀胱结石的大小。如果膀胱结石比较小，有机会经过尿道排泄，可以辅助药物比如排石颗粒，另外就是多喝水，如果膀胱结石较大，可以考虑膀胱镜取石处理。
膀胱结石自古以来就是在膀胱里生成的，就在膀胱里长，土生土长的。继发性结石是从别的地方来的，比如从肾脏输尿管排到膀胱，或者从尿道里被塞到膀胱去，这种结石叫做继发性的膀胱结石。原发性膀胱结石前列腺增生的时候，膀胱里出现残余尿，沉淀之后或者伴发感染之后就会形成结石。