不会很痛。刚开始有点疼很正常，是可以接受的，慢慢就会减轻。饮食清淡规律，忌辛辣刺激食物，可以考虑适当多喝水尿路冲洗。肾结石软镜手术后早期不要剧烈运动，多注意休息。
肾结石软镜手术通常会有一定的疼痛感。
肾结石是体内晶体物质析出后沉积于肾脏内所致的现象，可能使患者有剧烈腰痛的症状。在治疗时，可以采取肾结石软镜手术。在进行该项手术时，通常有疼痛症状。因为肾结石软镜手术就是把一根柔软的管子从尿道、膀胱里穿过去，然后塞进输尿管里，如果在没有麻醉的情况下进行，通常会产生疼痛感。所以，在做这个手术的时候，可以用麻药来减轻疼痛。如果肾结石的体积比较小，还可以通过药物进行排石，暂时无需手术。
通常情况下，肾结石软镜手术过程中是不会有任何痛苦的，术后可能会出现疼痛。
因为做输尿管软镜的病人，都是在麻醉下做的，并且是全身麻痹，不会有任何的痛苦。当然，经尿路和输卵管软镜的操作，就是从身体内部的天然空腔，经过尿路，再经过输尿管，再到肾，再用激光等碎石器械将其击碎，这样造成的伤害会更少，而且术后患者的痛楚也会少一些，因此，做软镜的患者并不会太过于紧张，因为一般都是很轻的。
肾结石软镜手术不痛苦，具体分析如下：
肾结石病人做输尿管软镜手术，手术时疼痛不大，大部分手术都是在全身麻醉下进行，属于微创手术，比开放性手术、经皮肾镜手术要少很多。术后要留置尿管，放置输尿管支架，术后会出现一定程度的不适和疼痛，但大部分病人都能忍受。因此，肾结石患者应该进行输尿管软镜检查，它是一种更安全、更有效的治疗方法。
肾结石手术之后取管子会有一定疼痛的。现在泌尿外科做结石手术一般是选择微创手术比如输尿管镜钬激光碎石术，输尿管软镜钬激光碎石术，硕通镜钬激光碎石术，经皮肾镜手术等。做完这些手术之后，体内都要相应放一个双J管，一般是起到一个支撑引流，防止结石堵住输尿管的作用。