尿分叉的最好治疗方法一般根据自身情况进行。尿分叉一般要治疗增强信心，消除思想顾虑，节制性欲，但不宜强制性禁欲，不能吃刺激性食物，忌烟酒。热水坐浴每晚1次，局部理疗，改变生活中明显的诱发因素，如避免长时间骑车等。
排尿分叉多见于前列腺增生症，前列腺轻到中度增生，尿道失去原有光滑度，后尿道凹凸不平或后尿道延长，出现排尿困难伴尿分叉。应该到三甲医院做详细的检查，评估是否需手术治疗。
尿分叉在临床上，有两种情况，一种是生理性的要分叉，不要担心，这不属于疾病，比如性生活刚结束，尿道里面有少量精液，这时候出现尿分叉属于正常的。还有一种尿分叉属于病理性的，比如肾结石，输卵管结石，尿结石，尿道里面发生了堵塞，小便的时候出现尿分叉，前列腺炎，出现了梦遗，尿液浑浊，失眠多梦，小便分叉，就需要进行药物治疗。
尿分叉可分为生理性和病理性，生理性尿分叉是由于尿道开口处临时阻塞尿道口，病理性尿分叉是由于尿道有炎症，比如慢性前列腺炎，尿道炎，尿道结石等，治疗主要是治疗原发病，针对导致尿道分叉的原因对症治疗。
排尿分叉是由于前尿道或尿道开口处暂临时有部分梗阻所引起的。偶尔出现尿分叉没什么大碍，如果经常性尿分叉，那么就应该注意了，当然，急性尿道炎发病期间，由于尿道充血、肿胀，分泌物多，也会引起排尿分叉。