胎儿畸形与精子无直接关系，胎儿畸形是指胎儿在子宫内发生的结构或染色体异常，的出现跟妊娠环境有关，比如孕期是否有放射线、环境的污染、某些致畸的药物、病毒感染、母婴血型等，都是导致胎儿畸形的原因，而这些跟精子质量关系不大。
精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。具体分析如下：
精子畸形是指正常男性精子的头、体、尾部出现变异形态，通常是由精索静脉曲张、精子在附睾发育障碍、生殖道感染等因素导致的。该情况可能会降低精子的活性，从而影响受精功能，使精子、卵子的结合能力降低。但是胎儿畸形一般是指胎儿在子宫内发生的结构或染色体异常，也就是精子和卵子在进行受精之前存在遗传物质异常，在受精之后出现基因突变等现象。所以，精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。
通常情况下，精子头部畸形一般是不会导致胎儿畸形的。具体内容如下：
人类每次射精的所有精子当中，都有一定的畸形率，包括了头部畸形的精子。这些畸形的精子本身的遗传物质并没有变化，只是其与卵子结合受精的能力下降。
加强体育锻炼，如散步、做操、五禽戏、八段锦、太极拳等。平日多用热水烫脚，刺激足底的经络和穴位，使身体处于温暖状态。
畸形的精子根本不会和卵子结合，精子畸形是可能影响受孕率的，对胎儿的发育影响不大，一般畸形精子受孕的几率是很小的，只要做好了孕期的检查像B超，彩超，唐氏筛查等，如果有异常应该是可以检查出来的。在怀孕前做好治疗，以免对胎儿有影响。建议选择到正规专业的不孕症专科医院做详细检查，针对治疗。
精子畸形不会导致胎儿畸形，胎儿畸形与精子畸形不是一回事。精子畸形只是形状不正常，影响受精能力，精子内在质量才是影响胚胎质量和流产的主要因素。单纯精子畸形率高不会导致流产率和胎儿畸形率升高，但是部分畸形精子症患者存在精子DNA碎片率高、染色体异常等疾病，才会造成流产率和胎儿畸形率升高。
精子畸形率越高，导致许多男性不育的可能性也越高，意味着受孕机率的降低，但与胎儿畸形并无明确相关性，畸形精子症并不一定会导致胎儿畸形。因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，精子在穿过女性生殖道的过程中会将大部分畸形精子淘汰掉，从而排除了畸形精子和卵子结合的可能，最终保证受孕的精子的质量。