膀胱结石形成后，如果是比较大，很难经过尿道排出，就会长期在膀胱里存留，会摩擦膀胱黏膜，引起慢性膀胱炎。而且可能膀胱结石与膀胱癌的发生有一定关系。所以有膀胱结石尽快去泌尿外科，取出结石。
如果结石单一，且个头不是特别大，采取经尿道的碎石的方法。根据结石的大小及数目来判断采取何种治疗方法。结石比较大，需要手术治疗。结石很小，可以多喝水，较小的结石可以排出。
膀胱结石的最佳治疗方法大体上两类，一类为手术取石，一类为非手术碎石，其中手术取石即传统的耻骨上膀胱切开取石术，另一类的非手术碎石则又可分为膀胱镜机械碎石大力钳碎石、液电效应碎石、超声碎石、弹道气压碎石等。
膀胱结石不治疗会有尿频、尿急、尿痛和终末血尿，常有排尿中断现象。前列腺增生引起继发性结石，可能仅有排尿困难。大的膀胱结石在直肠指诊有时能摸及。膀胱黏膜与不光滑的结石摩擦引起出血、感染、黏膜溃疡，偶可发生严重的膀胱溃疡，甚至穿破到阴道、直肠，形成尿瘘。
如果结石体积比较小，可以通过多饮水、多活动，甚至是做一些蹦跳的运动，让结石自行排出；如果结石体积比较大，需要选择介入手术的方式进行治疗，包括开放取石、激光碎石或者是体外碎石。