前列腺囊肿的治疗，比较小的囊肿一般不引起症状，可以用一些中成药物来治疗。定期做彩超复查看囊肿有没有变化。如果前列腺囊肿出现增大了导致一些排尿梗阻的症状，比如，尿频，尿等待，尿滴沥不尽，解尿时间延长等，可以考虑手术引流治疗把囊肿切除掉。
治疗前列腺囊肿如果囊肿小的考虑保守治疗比较好，若比较大的囊肿已经有压迫症状等，要少食辛辣，饮水过少不但会引起脱水，也不利排尿对尿路的冲洗作用，所以要适量饮水，绝对要忌酒，过度劳累会耗伤中气，不可过劳，避免久坐，不可憋尿以及防止受寒等。
较小而无症状的囊肿可以不必治疗，较大的囊肿或者有症状的囊肿，药物治疗无效，可以采用手术治疗。手术治疗的途径有经膀胱途径、经膀胱外途径、经会阴途径以及经直肠途径。腹腔镜切除前列腺囊肿具有组织显露清楚、手术时间短、创伤小、不造瘘、出血少等优点，是治疗向尿道后方及膀胱颈突起的前列腺囊肿的首选方法。
这种疾病，治疗率相对较高。在用中药治疗时，需要考虑药物治疗和治疗的效果。还需要知道的是使用中药来对疾病进行良好的分类。是对于前列腺囊肿应该考虑在疾病中完成中医的分类，易于计算应采用加减治疗。
如果囊肿很小，一般不必治疗或者药口服抗生素药物治疗，无效，可以实施穿刺治疗法，也可以手术治疗，如腹腔镜切除前列腺囊肿术，如果有生育要求的，手术时要保留精阜。
前列腺囊肿的治疗上应对症治疗，较小而无症状的囊肿可不必治疗。较大的囊肿或有症状的小囊肿可用手术治疗，途径有经膀胱、膀胱外、经会阴、经直肠等多种，常由于暴露欠佳致手术切除不完全，复发率高、并发症多。