治疗龟头炎的方法是要针对发炎的原因，因人而异。这个与病人的病情、生活的影响及身体是否有其它疾病都有关系。口服或外用的抗生素，主要用于治疗由细菌或霉菌感染引起的龟头炎。若龟头炎是由于皮肤受化学物品刺激而引起，就要避免再接触有关的化学物品。若龟头炎经常复发，而包皮又难以翻开清洗，那便要考虑是否需要进行切割包皮手术。
龟头炎不洁性生活史导致的，如果是病毒性湿疣，确定是何种病菌引起的炎症，对症治疗，念珠菌感染龟头炎是不可以单纯用常规消炎药来治疗的。在治疗龟头炎时，应该注意个人卫生，保持局部清洁，防止继发感染。
龟头炎多见于卫生不好导致，也可见于包皮过长引起，平时可以多进行清洗，注意卫生，暂停性生活，是细菌感染引起的龟头炎，可以用药物进行治疗，也可以到医院皮肤科就诊检查，在医生指导下进行治疗。
保持局部的清洁，避免各种刺激，每日清洗龟头和包皮，避免不洁性交，治疗期间暂定性生活，如为滴虫或念珠菌性龟头炎，应夫妻同时治疗，急性期避免使用皮质激素类药物，以免加重感染，包皮水肿严重者，切勿强行上翻包皮，包皮内板和龟头有溃疡或糜烂时要及时换药，每日换药2次。
保持局部的清洁，避免各种刺激，每日清洗龟头和包皮，避免不洁性交，治疗期间暂定性生活，如为滴虫或念珠菌性龟头炎，应夫妻同时治疗，急性期避免使用皮质激素类药物，以免加重感染。包皮水肿严重者，切勿强行上翻包皮，包皮内板和龟头有溃疡或糜烂时要及时换药，每日换药2次。少吃辛辣刺激性食物，忌烟酒。包皮过长或包茎导致包皮龟头炎反复发作者，应在炎症消退后行包皮环切术。
