怀孕后发现卵巢囊肿，若卵巢囊肿继续增大，体位改变或子宫挤压引起卵巢囊肿蒂扭转，腹部出现疼痛症状，需要进行手术治疗。
怀孕后发生卵巢囊肿常见于辅助生育的女性群体，因为辅助生育的患者，需要使用促排卵药物，而促排卵药会刺激卵巢，卵巢遭在受到过度得刺激后引起卵巢体积增大，从而形成卵巢囊肿。妊娠期卵巢囊肿患者出现急性腹痛，可能是由于卵巢破裂导致，应立即进行手术。
怀孕后卵巢囊肿建议疼痛手术进行治疗。
女性在妊娠期间由于盆腔充血，导致卵巢囊肿增大的比较快。如果是在怀孕的时候发现了囊肿，治疗的原则是从妊娠12周开始，到有手术指征的情况下，再继续观察。因为手术会导致流产等并发症，如果是在晚期，可以等到怀孕后再入院。剖宫产的时候，如果发现有卵巢囊肿，一般可以做手术。
怀孕以后由于女性的激素水平的增加，有的人会在一侧附件发现卵巢囊肿，这样的卵巢囊肿，一般直径小于五公分，而且囊壁比较薄，比较光滑。如果是在怀孕3个月内发现，可以定期的观察，大部分人会在怀孕三个月以后自然的消失。
怀孕卵巢囊肿一般需观察孕十二周，因妊娠后亦可并发黄体囊肿。卵巢囊性肿瘤是一种罕见疾病。黄体囊肿可随妊娠持续而自行变小，甚至消失。若是有恶变的可能时必须立即就医检查。最近若发生良性囊肿伴出血，不是扭转破裂，也不是疑似恶性的。若是子宫内膜异位而引起不孕时必须立即就诊。无论妊娠哪期，均应积极手术，以免耽误病情。卵巢是孕育胎儿最重要的场所之一，而子宫则对卵子起着保护作用。妊娠12周以前，卵巢囊肿手术不容易，由于妊娠12周前胎盘尚未形成，无法产生充足孕激素，无法维持胚胎发育。此时子宫内膜已开始增生并有成熟细胞分泌出大量孕酮，这时若对胎儿已经发生影响，就应及时终止妊娠。
建议孕妇保持良好的心态，主要休息，主要合理饮食。
出现卵巢囊肿如果没有超过5厘米问题不大，可以继续妊娠，定期复查即可，如果持续增大，需要进行治疗，可以到医院妇科就诊检查治疗。注意休息，不要吃油腻食物和高脂肪食物，不要吃辛辣食物。
妊娠发现卵巢囊肿，它的治疗要视孕期迟早而定、包块的尺寸及属性，及病人是否有病症。
早孕期间囊肿嵌在盆腔内，可导致流产，中期妊娠易合并蒂扭转，晚期妊娠，如果肿瘤很大就会引起胎位异常，分娩时会导致肿瘤破裂，如果肿瘤位置偏低，会梗阻产道，造成难产。
早孕并发卵巢囊肿，如在怀孕早期，卵巢囊肿直径在6厘米以下，可多为妊娠所致生理性囊肿，这类通常可在不治疗的情况下自然消退。如果囊肿一直延续到孕中期，未见萎缩，但亦不会增加，亦可在产后再行治疗。如果卵巢囊肿呈扩大趋势，或对恶性可能有较高疑虑者立即手术治疗。若妊娠期卵巢囊肿蒂扭转，还需马上做手术。