一般情况下，怀孕初期卵巢囊肿治疗要根据囊肿的性质和患者的症状决定。
1.如果囊肿直径在5cm以上，一般需要进行手术治疗，避免卵巢囊肿破裂引起急腹症。
2.如果是良性的生理性囊肿，囊肿直径在5cm以下，患者没有明显的临床症状，一般不需要特殊治疗。
日常生活中，应注意个人卫生，饮食清淡，作息规律，多休息，保持良好的心态，注意合理运动，增强自身的体质，有利于身体健康。
怀孕初期检查有囊肿可通过以下方式进行处理：
妊娠早期发现有囊肿可能是妊娠期间伴有的附件囊肿。妊娠伴有附件囊肿通常是一种良性的疾病，其病因包括内分泌功能失调、遗传、环境等。如果囊肿体积小，没有任何的临床表现，基本不会对怀孕产生什么不良的影响。如果妊娠时有严重的附件囊肿，伴随着孕周的延长而发生腹部疼痛，甚至会对怀孕造成一定的阻碍。如果囊肿的大小或者妊娠时的症状比较严重，可以在妊娠三个多月后进行适当的处理。对于高度怀疑恶性肿瘤的患者，应该尽早进行手术治疗。
怀孕初期有囊肿，需要定期进行B超检查，根据囊肿的大小来判断囊肿的大小。
如果囊肿比较小，则是由于妊娠后体内雌激素、孕激素增多，导致卵巢囊肿，一般在12周左右就会自行消退。
妊娠早期有囊肿，妊娠后随着妊娠时间的推移，囊肿会越来越大，会对胎儿造成一定的压迫，从而影响到胎儿的发育。孕期要补充足够的营养，促进胎儿生长发育。
怀孕初期卵巢囊肿不适的问题，考虑可能是跟激素分泌异常有关系，可能是存在感染的问题，容易对孩子的健康发育产生影响，定期的做孕期各项检查，观察胎儿的发育情况，合理的饮食，适当的增加营养，满足身体的生理需求。
孕妇体内的雌激素和孕激素水平会改变，从而导致生理性的卵巢囊肿，在妊娠前没有，在妊娠后会出现，多半是生理性的卵巢囊肿。
正常情况下，只要不超过3cm，就不需要做特别的处理，因为右侧卵巢囊肿会自动消失，所以要定期做B超检查，以了解囊肿的发育；如果右侧囊肿大于5cm，那么卵巢囊肿有可能会对子宫造成挤压，从而影响到胎儿的生长。
怀孕初期检查有囊肿，一般指的是怀孕同时合并附件囊肿。妊娠合并附件囊肿绝大多数都是良性病变，发病原因与内分泌功能紊乱以及遗传因素和环境因素等多种原因有关。囊肿体积较小时一般没有明显的临床症状，也不会对妊娠过程造成大的影响，一般无需进行特殊处理，注意定期复查。如果囊肿体积比较大，或者是妊娠期症状比较明显，可以在怀孕满三个月后选择合适的时机进行治疗。
