孕早期有褐色分泌物可能是因为胚胎着床时造成子宫内膜剥脱一部分。正常胚胎在发育时分泌绒毛促性腺激素，它虽能促进胚胎发育。
但同时又能促进子宫内膜增殖，内膜较厚时可局部脱落。若褐色分泌物量不多且无腹痛症状时，则注意休息，避免过于劳累。但若褐色分泌物量过大并伴腹痛时，应及时到医院就诊，在专业医生的指导下进行治疗。以免发生先兆流产。
考虑是先兆流产，胎儿不稳定，以及胚胎质量不好有关。大部分先兆流产的孕妇通过保胎治疗后，症状能够明显好转。但少数胚胎发育不良，在孕期持续出现阴道流血，最终可能会导致胎停，或难免流产。
一般情况下，怀孕初期偶尔有褐色分泌物可能是孕酮较低、先兆流产等因素造成的，具体内容如下：
1.孕酮较低：在怀孕初期时，如果女性体内孕酮较低，可能会出现褐色分泌物，女性应注意休息，要避免剧烈运动，避免情绪激动，必要时需要就医进行治疗。
2.先兆流产：如果女性在怀孕初期偶尔有褐色分泌物，还出现腹痛、阴道流血等症状，则可能是先兆流产造成的。女性应及时就诊，遵医嘱使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片等药物进行保胎治疗。
妊娠早期褐色的分泌物与妊娠早期的褐色分泌物有关：1、如果褐色的分泌物不多，无其它表现，可能是孕卵着床的一种生理反应，也称为着床出血；
2、怀孕初期突然发生碰撞、摔倒等情况；
3、也有可能是因为先兆流产，出现的时候会出现棕色的分泌物，颜色从深变红，同时还会出现不规则的下腹部疼痛；
4、孕妇过度劳累、便秘、宫颈息肉、宫腔息肉等都会导致褐色的分泌物。
一般来说，怀孕初期淡褐色分泌物是胎儿发育不稳定导致的。
妊娠早期出现浅棕色的分泌物，可能与子宫、阴道有关，如果是子宫引起的，可能是胎儿发育不稳定，同时伴有下腹部坠胀、疼痛等可能是先兆流产，建议去医院做超声波检查，确定胎儿是否正常。女性阴道流出浅棕色的分泌物，伴有疼痛、烧灼感，提示阴道破溃，不能排除是阴道感染。
怀孕早期出现褐色分泌物，可能是由以下几个原因导致：
1.受精卵刚着床引起的着床出血表现，一般出血量比较少，而且在1-2天左右可以自然干净。
2.考虑是孕激素偏低导致的先兆流产现象，常会伴有小腹隐痛，而且查血HCG和孕酮会发现孕酮偏低，这时就需要进行保胎治疗。
3.考虑是受精卵没有在宫腔内着床，而在宫外着床导致的宫外孕征兆。这时的褐色分泌物会持续出现，而且伴有下腹部的持续疼痛，在宫外包块破裂的时候，就会引起剧烈的腹痛甚至是失血性休克。建议及时到医院进行手术治疗。