MRI不使用对人体有害的X射线和易引起过敏反应的造影剂，因此对人体没有损害。不用太担心。mRI可对人体各部位多角度、多平面成像，其分辨力高，能更客观更具体地显示人体内的解剖组织及相邻关系，对病灶能更好地进行定位定性。全身各系统疾病的诊断，尤其是早期肿瘤的诊断有很大的价值。特别是对于膝关节或者说是肩关节这种部位的检查。可以有效的看到局部的关节软组织韧带是否有一些损伤。这种检查对人体没有什么损害，不像CT一样有辐射。只要是没有一些金属性的物体或者说是假肢就可以。
核磁共振检查是脊柱系统疾病的一种非常常见的辅助检查方式，由于对软组织以及骨骼系统均有良好的成像效果，所以，主要用于检查脊柱脊髓神经以及周围软组织的病变。磁共振对于脊柱系统疾病的检查范围非常广泛，胸椎磁共振检查主要用于胸椎结核，胸椎的骨折脱位，胸椎段脊髓神经的病变以及损伤，胸椎及胸椎周围的良恶性肿瘤、转移瘤以及胸椎周围软组织、韧带的急慢性损伤等。
所有的矮小症都需要做核磁共振检查，垂体是分泌生长激素的地方，如果垂体发育不良或者外伤会导致生长激素分泌减少，而矮小症需要排除垂体的微腺瘤才能治疗。
除此之外，还需进行激素分泌检查，通常需要明确出现该病症的病因，并对症进行治疗。平时，家长需要注意保持宝宝营养摄入均衡，可适当运动，促进身体吸收，可以改善病症。
发生滑膜炎是，有些需要做有关磁共振检查，通常可依据患肢磁共振检查，对病人软骨受损害程度进行分析。
当病人发生滑膜炎时，应及时对其发病原因加以分析，例如，有些病人就是发生创伤而导致，发生半月板或前交叉韧带或后交叉韧带损伤，有时周围韧带受损，因而引起滑膜炎。根据病因分析，一般病人应做磁共振检查，以观察病人半月板损伤情况，交叉韧带损伤轻重，从而做到有的放矢。通常应跟随病人治疗病因，从而使病人滑膜炎终于可以得到治愈。
头颅核磁共振检查脑内的梗塞病灶、梗塞的位置。头颅磁共振能够显示头颅任意断面的解剖结构，对软组织的分辨率比较高，没有骨性的伪影，可以清楚显示脑干和后颅窝的病变。主要是用于诊断脑梗死、脑炎、脑肿瘤、颅脑先天发育畸形和颅脑外伤等。
可检查盆腔所有的脏器，子宫、附件、直肠以及膀胱。核磁共振检查是一种比较特殊的成像检查方法，对人体肌肉组织病变有很好的效果。做盆腔检查前不需要做特别的准备，但注意检查时不要佩戴金属物品，不佩戴眼镜、项链、手表、耳环。