在新型农村合作医疗制度下，堕胎住院通常是可报销的，主要取决于住院的天数和住院费用是否超过当地最低报销水平。如果没有最低的当地报销水平，通常需要支付自己的费用。如果有的话，在报告其余费用之前，需要减去这个最低水平。
流产住院社保如果单位参加了生育险流产住院是可以报销的。原因分析女性子宫环境不太好而且妇科有炎症，怀孕之后不太注意生活习惯和动作，就比较容易出现流产的现象，而且避孕不到位也比较容易出现自己要流产的现象。
可以报销费用，但需连续缴纳医保6个月以上才能享受医疗费用报销。意外流产医保是不给予报销的，一般的门诊的妇科病都是不能医保报销的，只有住院后可以按比例报销一部分。意外流产对于流产原因要检查清楚，避免以后再发生意外流产，流产以后要好好的休养一个月左右，避免着凉，注意保暖，加强营养，有助于身体早日康复。
先兆流产的可能下还是积极卧床休息和保胎即可，注意不要有压力，但是具体的标准等还是及时到医院选择检查或者咨询看一下，但是注意在怀孕早期减少剧烈活动即可，平时要注意卫生，要注意饮食的清淡，不要吃辛辣的带刺激性的食物。
如果是做过人工流产，这不属于生育保险津贴范围之内，是不能做报销的。生育保险在剖宫产时，是可以报销的，基本上是可以报销90%左右。但是流产以及引产不属于报销范围的。这属于自负的项目。
流产手术医保是不能报销的，不论是农村合作医疗还是医疗保险，人流手术都不在报销的范围之内，如果是引产手术，需要住院5~7天，办理住院手续，农村合作医疗可以报销一部分。