生化妊娠是指怀孕早起宫内看不到孕囊出血，而流产一般是指检查宫内看到孕囊后由于其他原因导致出血胚胎组织排出来结束妊娠。生化妊娠就是受精卵未着床，可以算自然流产的一种生化妊娠，是指精卵结合了。
生化妊娠也是属于自然流产的一种，两者最大的区别来说就是怀孕时间的长短方面。生化妊娠是在排卵期同房后有受精卵的结合，然后有受精卵在宫腔内着床，但是着床不稳，随着月经出血被排了出来，如果不特意去查血HCG，很多人都不知道发生了生化妊娠。自然流产往往会有月经超期不来，经过检测，能够查到怀孕，但随着妊娠的进行胚胎死亡或者停止发育，然后有类似月经量的出血。
生化妊娠也是属于自然流产的一种，区别是怀孕时间的长短方面。生化妊娠是在排卵期同房后有受精卵的结合，然后有受精卵在宫腔内着床，但是着床不稳，随着月经出血被排了出来，如果不特意去查血HCG，都不知道发生了生化妊娠。自然流产往往会有月经超期不来，经过检测，能够查到怀孕，但随着妊娠的进行胚胎死亡或者停止发育，然后有类似月经量的出血。
生化妊娠是自然流产的一种特殊类型，是通过查血绒毛膜促性腺激素已经明确诊断是怀孕，但是彩超检查没有探及妊娠依据，然后自行出现阴道流血，血绒毛膜促性腺激素下降至正常。而自然流产包括生化妊娠，还有一种情况就是彩超已经明确诊断是宫内早孕，然后胚胎停止发育或自然流掉。
生化妊娠是受精卵还没有进入宫腔的时候就已经夭折了，自然流产是孕囊已经进入宫腔，由于各种原因而导致了流产。一般生化妊娠发生的时间会早一点。因为40天之后孕囊才会进入宫腔，也就是生化妊娠会发生在怀孕的40天之内。自然流产发生在怀孕到40天之后。
自然流产大多指的是自然状态下发生的流产，根据孕妇怀孕时间长短分为早期流产、晚期流产，早期流产指的是怀孕12周以内，晚期流产指的是怀孕12-28周之间。生化妊娠多指的是精子与卵子结合后未顺利着床，发育成死胎的情况，常表现为HCG阳性，B超未见孕囊。生化妊娠对身体无太大的伤害，生化妊娠期间很像来一次月经，出血量与月经量差不多，基本10天左右可以流干净。