该药的副作用包括以下几方面，首先长期注射黄体酮可能会引起胎儿畸形，例如造成女性胎儿男性化或者增加脊柱裂的风险，其次打黄体酮可能会造成水钠潴留，引起孕妇体重增加，组织水肿。然后打黄体酮可能会引起患者头晕以及恶心呕吐，主要是由于黄体酮有舒张颅脑血管以及刺激胃肠道的作用。
黄体酮是属于孕激素，有维持妊娠继续的作用，尤其在怀孕70天内，如果过量使用，可能引起男性胎儿有一定女性化倾像，女性胎儿阴道腺疾病增加，普通使用不会导致这些副作用的。要多注意休息不能劳累。
通常来说，保胎黄体酮一般打几天，需要视情况而定，具体分析如下：
一些黄体酮可以起到抑制宫缩的作用，如果是由于孕酮不足引起的出血、腹痛，服用黄体酮后症状会有所改善，通常情况下服用一周左右即可恢复正常。先兆流产通过使用黄体酮也仍然继续发展为难免流产，不全流产或者完全流产很快就会停掉黄体酮，如果病情进一步恶化，那么就会导致流产。
要根据每次复查结果，看孕酮上升的程度而定，如果服用黄体酮后，血液中的孕酮的数值升到正常，就可以逐渐地减少用量，一周至十天左右再去复查一下，如果仍然保持正常，就可以停掉黄体酮了。
注射黄体酮保胎，停药的标准就是流产症状消失后三天停药，继续治疗3天就可以停药，黄体酮属于孕激素可以引起恶心等症状，停药后就会缓解的，注意近几天吃易消化的食物。
黄体酮栓保胎没有影响。
孕妇在确诊怀孕之后，如果检查发现孕酮偏低，但是没有出现阴道流血，就可以在医生的指导下服用黄体酮胶囊，加上黄体酮栓来进行保胎治疗。但是如果孕妇存在阴道流血的情况，使用黄体酮栓就会影响保胎效果。所以孕妇的保胎治疗一定要在医生的指导下进行。
建议孕妇在确诊怀孕之后，及时补充叶酸，并避免发生性生活。