造成孕囊形状不规则的原因有好多种，一是精子卵子的质量不好，形成的孕囊质量不好，再有是自身激素水平有问题，还有是子宫内膜有炎症，都有可能造成孕囊的形状发育不好，像这种症状，观察几天再做复查排除，宫内停育的可能，如果没有阴道出血和腹痛的症状，观察几天再做复查。
有可能是后期受孕，怀孕的时间还比较短而导致，也有可能是胚胎发育不良或者胚胎已经停止发育而导致的。查血HCG及孕酮，再综合判断。如果没有明显出血及腹痛，一周以后再做B超复查来作比较。通过对比如发现孕囊发育正常，不需要任何的处理；如果考虑是胚胎停育，需要及时行清宫处理，否则容易引起凝血功能异常发生大出血或宫内感染等。
一般情况下，导致有孕囊无胚芽的原因有以下几个。
1、患者在怀孕40天左右，做B超时发现只有孕囊没有胎芽的情况。可能是做B超的时间较早,胚芽还没有完全生长导致。建议两周后再复查B超。
二、患者怀孕长达60天左右，做B超依仍旧发现只有孕囊没有胎芽,就需要进行系统检查，看是否是胚胎停育的情况。
建议患者多喝温水、多休息，尽量少吃或不吃油腻、辛辣的食物，不得饮酒或含有酒精的饮料，以免诱发其他疾病。
一般孕囊偏低的是在子宫的下段，很容易流产的，所以需要观察的。如果是想要这个孩子，可以观察一周后去医院复查B超的，如果还是这个位置，没有游动，那么是要流产的，否则可以导致大出血等时间长，胎盘在这儿形成就是胎盘低置的，也很容易出血的，流产后注意休息，一般是不影响以后的生育的。
孕囊形态不规则提示胚胎发育不良可能性大。卧床休息和注射黄体酮保胎治疗，一周后复查B超，若孕囊无明显增大、仍未见胚芽，可确诊稽留流产，继续保胎没有意义，须行清宫术。