精子畸形率高需根据发病原因进行针对性的治疗，忌烟忌酒、适量运动并保持充足睡眠，避免不良嗜好损伤睾丸功能，导致精子畸形。远离辐射、污染等居住环境，避免过多接触化工原料。治疗包括睾丸炎在内的炎症，以及精索静脉曲张。则可通过人工授精等方式实现生育。
精子畸形率高可以多吃一些温阳补肾的食物，比如羊肉，狗肉，牛肉的食物。精子畸形率高的原因有吸烟喝酒、泌尿生殖系统感染、内分泌紊乱等。平时一定要注意适当的加强运动，注意饮食清淡，禁辛辣刺激食物，多喝点热水，多吃青菜和水果。
药物营养剂补充和食补。精子生成需要营养物质的供给，营养不良或不均衡均会影响精子的生成。营养成分中的胆固醇、精氨酸锌与生育的关系最为密切。一些蔬菜有生精能力，可提高精子数量与质量，同时还要再服用营养剂补充。
精子畸形率高主要有先天性睾丸发育不全、精索静脉曲张、副睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频等，还和平时的生活习惯有关，如辐射、高温作业、烟酒等。如何改善精子畸形率要做到：首先照顾好睾丸，不要穿紧身衣裤，否则会引起温度过高、束缚过紧，这些都是影响精子畸形的原因。
引起的原因有：不健康的生活方式，酗酒也是常见的造成精子畸形的原因之一：已有研究证实，酗酒产生的酒精中毒可能损伤精子，造成精子畸形率增高，同时还可造成性欲冷漠、阳痿、早泄等性功能的异常。再者男子泌尿与生殖系统的某些感染：也是造成精子畸形的重要原因之一。较常见的影响精子畸形的感染，如：前列腺炎、精囊炎、尿道炎等。
可以在医生的指导下，服用药物，具有一定的促精子发育的作用。如果效果不好，可以做精子的筛选。如果精子的畸形率过高，对怀孕的几率有一定的影响，即便是同房后怀孕，也容易出现胚胎发育不好情况的。