肾结石可以通过口服药物或者通过手术排斥治疗，在治疗期间要适当多喝水，多排尿，多运动促进结石的排出，恢复期间不要吃一些辛辣过多油腻的食物，而且也不能喝酒和吸烟。平时要避免进食高钙食物，以及富含维生素的食物。
一般情况下，肾结石治疗方案有有以下几种：
1.总体治疗
（1）大量饮水保持尿量超过2000毫升。
（2）调整饮食，避免高盐、高蛋白饮食。草酸钙结石要避免食用高钙、草酸高的食物。
2.去除原发病因素
3.药物治疗：紧急使用药物，改善症状，排石药物，预防结石复发。
4.手术治疗：体外震波碎石，输尿管镜取石，经皮肾切开取石术，开放性手术。
双肾结石现在又很多中老年男性都会出现，这和生活当中的不良习惯都有关；结石这么大，可能要借助手术治疗才能把结石取出来，至于手术是一次做两侧还是分次进行，还需要进一步检查。为了慎重起见，做一些临床检查，以明确具体诊断，方便进一步采取何种手术治疗。
治疗肾结石最常见的办法是碎石，因为肾结石如不及时排出体外，可以引起反复尿路感染，影响肾功能。不是所有的病人应用碎石可以解除肾结石，体积较大的结石或者双肾多发的结石碎石效果不好，需要应用手术取石治疗。
多性肾结石的治疗方法可以通过手术治疗，但是如果结石也比较小，可以观察一段时间，先不用特殊处理，如果已经有了症状，造成了血尿，蛋白尿或者是肾功能的不正常。可以手术进行缓解。
肾结石治疗后隐隐疼痛难忍可能是正常的现象，也可能是手术切口过大引起的。
由于患者通过手术后，局部麻药时间已过，会出现疼痛现象，一般在手术后24小时疼痛会比较明显，一般会在48小时至72小时后，疼痛可出现明显缓解。这属于正常现象，患者无需采取特殊治疗措施。
除上述原因外，患者出现这种情况，还可能是手术中切口比较大，从而损伤末梢神经所引起的。患者可遵医嘱使用阿司匹林、对乙酰氨基酚、吲哚美辛、双氯芬酸钠等药物进行治疗。