晨尿痛第二次就好了最常见的原因是泌尿系感染尿道炎。常见的泌尿道感染原因包括饮水量过少、食用过多辛辣刺激性食物，长时间憋尿、不注意卫生、频繁手淫、不洁性行为、熬夜、劳累等。
尿痛是指排尿时或排尿后耻骨上区或尿道内烧灼样，针刺样痛感，与尿频，尿急合称为膀胱刺激征。病因多见于膀胱，尿道炎症或结石。病变刺激膀胱及尿道粘膜和深层组织，引起膀胱、尿道痉挛及神经性反射。排尿初痛多见于尿道炎，而膀胱炎为排尿中或排尿后痛。注意观察尿道口是否有脓性分泌物。通常需要口服抗生素进行治疗的。
男性尿痛可能是多种原因导致的，具体分析如下：
前列腺炎，尿道感染，尿道炎等都会引起尿痛。前列腺炎是一种很常见的慢性炎症，与前列腺反复充血，经常同房，自慰等因素有关。尿道是从前列腺内部经过的，前列腺炎症会刺激尿道，导致排尿疼痛。尿路感染、尿道炎等都会导致尿道炎症引起的疼痛。需要去医院做一线腺液和尿检。
尿频、尿急、尿痛是尿路感染和慢性前列腺炎的常见表现。
前列腺部尿道压力升高，尿液倒流到前列腺，尿液对前列腺的刺激会引起局部炎症，导致尿频、尿急、尿痛等临床表现。如果尿液中有细菌感染，也会导致细菌逆向进入前列腺，从而导致细菌性前列腺炎。对此，一般会对病人的生活、学习产生一定的负面影响，因此必须采取积极的措施。
临床上可以选择坦索罗辛、前列康等药物，抗菌素可以选择喹诺酮类的抗生素，也可以选择大环内酯类的抗生素。
尿痛可能是泌尿生殖系统感染，引起的，比如尿道炎症，可以到医院做一下尿常规检查，和泌尿生殖系统的，彩超检查。根据检查结果进行针对性的治疗期间注意，期间注意，局部清洁，饮食清淡。