最常见的原因有：物理因素，包皮长期的翻转嵌顿、性生活擦伤、过度洗涤及暴力创伤等；过敏因素，包括蚊虫叮咬、涂抹药物或应用避孕药具等；感染因素，冠状沟及包皮有电灼手术史、激光，造成术后感染，或其他原因导致包皮细菌性感染而形成水肿。
患包皮水肿的原因有可能是短时间内频率性生活、刺激强度较大或者性生活时间较长；包皮手术之后以及不注意个人卫生导致包皮发炎；吃了辛辣刺激性食物，比如辣椒，海鲜，烧烤，以及蚊虫叮咬有很大关系，属于一种急性的过敏反应。
包皮水肿是由于包皮局部循环障碍导致皮肤粘膜肿胀，可以分为感染性因素，过敏性因素和物理性因素这三个方面。不注意生殖器清洁卫生，过度粗暴的手淫，频繁的性生活，不洁性生活，包皮龟头炎，蚊虫叮咬，包皮长时间嵌顿，包皮手术，激光烧灼等都有可能导致包皮水肿。
形成包皮水肿的原因有感染因素，冠状沟及包皮有激光、电灼手术史，造成术后感染。或其它他原因导致包皮细菌性感染而形成水肿。过敏因素，包括蚊虫叮咬、涂抹药物或应用避孕药具等。理因素，包括性生活擦伤、包皮长期的翻转嵌顿、过度洗涤及暴力创伤等。
不注意个人卫生。由于青年男性朋友包皮的皮脂腺分泌通常都会比较旺盛，男性朋友若是不注意清洗外，或在清洗的时候没有把包皮上翻，包皮皮脂腺的分泌物就会积存在包皮下，因此就会形成像豆腐渣样的包皮垢。包皮垢是细菌的良好培养基，若是不及时清除就很容易导致包皮水肿。