真菌感染性龟头炎，主要是白色念珠菌感染引起的，每天早晚外洗，每天涂抹药膏三次。完全康复需要4-6周的时间。治疗期间不能选择同房，因为真菌的传染性是比较强的，很容易导致出现交叉感染。穿过的内裤要用开水烫，在太阳下暴晒，因为真菌对高温是比较脆弱的，很容易被杀死。
阴性真菌龟头炎只是一种普通的疾病，是指龟头粘膜的炎症病变，有包皮过长的现象，但是因为症状和一些性病相似，因此不容易辨别，所以需要去进行检查并治疗。龟头炎指龟头部由外伤、刺激或感染等因素引起的黏膜炎症。可由多种因素引起，如局部的各种物理因素刺激（创伤、摩擦、避孕用具、清洁剂、尿液等）、包皮过长、包茎、包皮垢刺激、各种感染（细菌、真菌、阿米巴原虫、滴虫等）以及药物过敏等。
到正规的大医院就诊，给予做细菌培养，针对性的治疗，平时注意卫生，经常清洗，不穿过紧内裤，忌手淫，多采用药物治疗，包括应该外用抗菌药，如果合并包皮过长或包茎需要切除包皮。
如果龟头炎真菌镜检阴性，可能是单纯的龟头炎症刺激造成的。要注意保持局部卫生，如有包皮过长，应行包皮环切术，穿纯棉内裤。平时少吃辛辣刺激食物，尽量不要抽烟喝酒，性生活前后两个人都要注意清洁。
得了真菌性龟头炎，首先可以使用妇炎洁洗液或者是碳酸氢钠溶液进行冲洗。局部一定要保持清洁干燥，涂抹外用药膏，一天涂抹2~3次，坚持用药7~10天，然后再到医院取分泌物复查。真菌性龟头炎是很容易复发的，患者的生活习惯也要改善，一定要多喝水，内裤要穿全棉材质的，而且内裤要勤更换，换下之后使用开水烫20分钟，然后在太阳底下暴晒，这是杀灭真菌的好方法。
一般来说，真菌感染龟头炎可以使用药物治疗。
白色念珠菌感染会导致真菌感染性龟头炎，局部可用5%的碳酸氢钠溶液或高锰酸钾粉1:5000外洗，局部可用硝酸咪康唑软膏或克霉唑软膏外用。每日早晚用，彻底恢复要花4到6个星期。在治疗过程中，由于真菌具有极高的传染性，很容易发生交叉感染，所以穿着的内衣要用热水烫一下，放在阳光下曝晒，细菌在高温下很容易被杀死。
