精子畸形影响还是很大的，精子畸形与受精能力有很大的关系，精子畸形率高，受精能力会相对减弱，从而造成不育。但与胎儿畸形其实关系不是很大，胎儿畸形更多的与遗传、母体环境、用药、外界不良环境等因素有关。
吸烟时间越长，精子畸形的数目就会越来越多。如果是身体内有的相关激素的分泌不调，就会导致畸形率的上升。由于存在泌尿生殖感染疾病，精液中的营养物质就会大大的减少，导致精子发生畸形或是直接死亡。
精子畸形率影响小孩儿的。因为精子畸形率高的时候，是不可以怀孕的，就应该改善后再怀孕。因为精子的头过大或其他形态异常，由于本身就不利于穿透宫颈粘液所形成的微小通道。
不育；可见倦怠乏力，纳食不香，腹胀闷，或腰膝酸软，伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现；部分病人有性功能障碍等症状。子畸形也叫畸形精子，是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等；体部畸形有体部粗大、折裂、不完整等；尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。
精子畸形病患经常表现出纳食不香，倦怠乏力，腰膝酸软，或腹胀闷，伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现。不育：有些人会由于畸形精子症产生不育的情况。要是畸形精子的所占的百分比高于50%，可能会导致男性不育。
精子畸形会影响怀孕。精子畸形，通过精液分析来进行检查，在精液分析检查中包括精子形态学检查，在正常成年男性，如果形态正常的精子占比较小，考虑是畸形精子症，出现精子畸形症会影响怀孕。