性功能障碍的病因很多，有的患者受某种信仰观念的影响，会使患者对性生活产生反感，从而造成性功能障碍，还有的患者也会有器质性的疾病，例如糖尿病患者，睾丸发育不良等。
有些患者会有雄性激素和雄性激素的分泌不正常，从而引起性功能的紊乱。还有一部分患者由于精神上的问题，例如第一次发生性生活，精神上的紧张，没有足够的性经历，没有足够的性技能，会造成某些不正确的性欲，最终造成患者的性欲失调。对于这种情况，要想有效的解决，首先要解决的就是这些原因。
导致性功能障碍的原因很多，比如：尿道上裂，阴茎弯曲，精囊炎，前列腺炎，精索静脉曲张，以及其他内分泌方面的问题。
如果患有了性功能障碍，需要及时的进行治疗，这是一种对病人有很大伤害的病症，会对病人产生很大的精神负担。在日常生活中要注意饮食方面要注意清淡，要避免抽烟、喝酒，不要食用辛辣刺激的食物，适当运动。
在临床上，引起性功能障碍的原因有：
第一点，就是生理上的问题，当人类变老时，性机能就会慢慢衰退。
第二，是心理上的原因，此外，也存在着一定的心理和心理问题，比如说患者在做爱的过程中会很紧张，也会因为之前的性爱失败而产生不正常的行为。还有一些性机能失调，这也许是因为宗教的文化观念造成的。
第三，也有可能是由于肥胖症引起的，患有糖尿病的患者，可能会引起性功能障碍。
男性性功能障碍包括性欲障碍、阴茎勃起障碍、性交障碍和射精障碍。女性性功能障碍包括性欲障碍、性唤起障碍、性高潮障碍、性交疼痛等。包括性厌恶、性欲低下、性欲亢进。性交障碍的临床表现为性交昏厥、性交失语、性交癔病、性交猝死、性交恐惧症等。
心脏疾病可能会引起性功能障碍，建议患者积极治疗，具体分析如下：
性功能障碍可能是由心脏疾病引起的，主要表现在某些特定的心脏病上，如房颤、病态窦房结综合征、心肌梗死、预激综合征等。在正常情况下，当人体处于亢奋状态时，心跳的水平和节律都会增加，当出现心脏疾病时，性经冲动被抑制，就会出现性功能障碍。如果是心功能不全，如果长期服用药物，也会导致勃起功能障碍或者是勃起硬度不足。
男性性功能障碍可能由遗传、健康状况、激素水平、年龄、疾病（包括慢性病、神经精神系统疾患、内分泌疾病、生殖器官病变）等多种原因所引起。药物、长期大量酗酒或吸毒者，也会出现性功能障碍。精神心理因素对性功能的影响比较突出，包括错误的性观念、过去性经历的影响、环境因素、人际关系紧张等。