附睾炎引起的不孕应首先治疗。附睾炎长期不治疗，可能影响精液质量。治疗附睾炎时，应先静脉注射消炎药，待症状好转后再口服药物治疗。像常用的消炎药这类的。另外，阴囊要尽量抬高，适当热敷，可改善附睾炎症状。
慢性附睾炎治疗：慢性附睾炎常和慢性前列腺炎同时存在，所以一般治疗措施与慢性前列腺炎相同。治疗前列腺炎的同时可使慢性附睾炎的症状缓解，附睾炎愈合后遗留附睾硬结有时可造成病人的思想负担，手术切除后不一定都能缓解症状，因此一般不做除睾切除术。因双侧附睾炎后精子输出受阻的男性不育症，行输精管附睾梗阻部位近端吻合，虽能部分解决精子引流问题但术后受孕率不高。
如果吃了两个月消炎药附睾炎还没好就要考虑进行手术治疗了，附睾炎是男性生殖系统非特异性感染中的常见疾病，多见于青壮年。其自然病程约四周，此病常可累及睾丸或影响其血运导致睾丸缺血，萎缩，甚至造成不育。
附睾炎梗阻这个需要通过手术治疗，如果是附睾炎导致输精管或者是射精管梗阻，就会影响到怀孕，需要积极配合治疗，规律饮食平时不要吃辛辣刺激，容易上火的食物，治疗期间需要禁止性生活。
患有附睾炎之后简单的方法是采用局部理疗、外用药物治疗，对于反复发作的病人，可行手术进一步治疗。病人应卧床休息、避免步行太久、用阴囊托起阴囊减轻疼痛，根据病程不同，还可以采取冷敷、热敷、口服抗生素等治疗。