畸形精子症是由生殖道感染引起者，可进行抗炎治疗，由内分泌异常所致者，则给予内分泌功能调整，应考虑手术治疗。畸形精子症的治疗高畸形率精子症所致不育症应根据引起畸形精子的原因，消除不利因素(药物、放射线、高温、酒等)，针对病因进行治疗。畸形精子如超过70，应进行染色体检查。
可以检查精子粘稠度；精子的存活率；精液的量；看正常精液的PH值，酸碱度；精子数量；畸形精子的数，多吃一些含锌的食物，注意补充营养，提高精子质量，注意营养均衡，少食辛辣。
早期精子畸形可以到正规医院的男科或都不孕不育科进行染色体的检查，由于染色体异常的原因导致精子畸形的情况并不少见，所以这项检查是非常有必要。病情确诊之后，要遵医嘱进行治疗。
畸形精子的诊断与检查，体格检查：多无明显异常体征，伴精索静脉曲张者局部可有肿大或触痛，伴前列腺炎者可有触痛及结节；理化检查：显微镜下精子畸形数超过正常值的20%以上；诊断要点：凡通过精液常规全自动电脑分析仪检查，镜下精子畸形数超过20%者，即可诊断为畸形精子过多症或畸形精子增多症。本症常与前列腺炎、精囊炎合并出现。
精子畸形症是正常形态的精子少于50%，即精液中畸形精子超过50%。所谓畸形精子，就是发育不好的精子，畸形精子过多症是指在生育年龄的男性畸形精子症使男性不育的常见原因之一。
怀疑精子畸形可以做一下精液常规检查、前列腺液检查和睾丸检查。一般还可以做精液镜检；精液常规检查及前列腺液检查；精液微生物学检查；血精、精浆抗精子抗体检查；精液生化分析等。